Чем скреплять деревянные брусья?

Да, такие пружинные болты существуют (см. фото):



На мой взгляд на сегодняшний день это лучшее средство против появления щелей от усушки брусьев. Ну, а самое лучшее, это, конечно, применять сухой брус изначально    
Подробнее про пружинные болты см. здесь.

Как это он у Вас сел сам? В том то вся и прелесть, что пружинные болты помогают сесть брусьям сесть. И, если бы Вы их применили, то и нижние Ваши брусья сели больше и фронтоны конопатить пришлось бы меньше.

Ну, если для Вас время не деньги, то можно и так. Важно же еще то, чем Вы закрепляли венцы друг к другу, а то они и зависнуть могут, т.е. не сядут даже на 1 этаже под весом всей стены и тогда щели будут измеряться сантиметрами!

Знаю ,что в нашем дачном поселке есть дома из брусьев, которые соединяли березовыми нагелями, а есть, которые приколачивали друг к другу огромными 250 мм гвоздями. Похоже, что эффект один и тот же. Все дома немного зависли, особенно во фронтонах второго этажа. Короче, по словам хозяев всем пришлось конопатить.

..не совсем верно...не должны нагели деревянные свободно "ходить", они должны устанавливаться в "натяг", ежели нагели меньше диаметром,тогда они должны обматываться каким-нибудь уплотнителем (пакля антисептированная и т.п)).."завис" происходит из-за недостаточного  усушечного и монтажного зазора в посадках нагеля ( деревянный, металлический (гвоздь),пластиковый и т.д.) или несоосность отверстий в скрепляемых венцах...при метал/нагеле типа гвоздь или пластик/арматура венцы зависают на шляпках или концах нагеля,т.к халтурщики не утапливают их пробойником или не делают  углубления, а веса венцов не хватает продавить эти нагели...кстати, деревянные нагели из березы (черенки от граблей или лопат) желательно не применять, а ежели применяете, то от зависания на нагеле березовом обязательно делать широкую фаску на торцах...

...ежели веса " не хватат", тогда делается обычная принужденная усадка,которую применяют всегда при правильном монтаже, а эти  потешные "пружинные болты", которые устанавливают "абы как", годятся только " для крошки Минни,когда киска оцарапает ей пальчик" (с) (О.Генри)